中科院北京基因组研究所博士研究生招生基因组学大纲

2015-10-27 16:05:52来源:网络

  4. 蛋白质组与表观组学研究

  考试内容

  l 蛋白质的合成与蛋白质翻译调控

  l 蛋白质翻译后加工与蛋白质降解

  l 蛋白质组研究的基本方法和原理(如双向电泳和质谱)

  l 表观遗传学定义与遗传机制

  l DNA甲基化与表观遗传

  l 染色质重建与表观遗传

  l 表观遗传学通路

  考试要求

  l 简述鉴定蛋白的基本方法、分析蛋白质功能域的方法

  l 掌握蛋白组研究的基因方法和原理

  l 掌握表观遗传学定义及表观遗传机制

  l 掌握DNA甲基化、染色质重建与表观遗传

  l 掌握表观遗传状态的传递与表观遗传密码

  5.基因组进化的分子基础、模式和研究方法

  考试内容

  l 突变的机制,突变的类型及突变对细胞生物的影响

  l 重组的类型与重组发生过程

  l 转座是基因组进化的一种重要方式

  l 新基因的产生

  l 非编码序列的扩张

  l 比较基因组学研究

  l 分子系统发生学与生物进化

  l 基因组与生物多样性

  考试要求

  l 了解突变对基因组进化的影响

  l 掌握重组的类型及不同重组模型核心内容

  l 掌握新基因产生的方式

  l 掌握比较基因组学研究方法

  l 掌握DNA系统发生树重建

  l 掌握现在人基因组与黑猩猩基因组的异同

  6. 基因组信息分析数据库和软件

  考试内容

  l 基因组信息研究与常用物种数据库

  l 基因表达数据分析与常用数据库

  l 基因的组装和重复序列识别软件及原理

  l 转录组数据分析常用软件

  l 基因识别常用软件(真核生物和原核生物)

  l DNA序列的进化分析常用软件及分析过程

  考试要求

  l 了解国际主要数据库(如Genbank)和常用工具(如blast)

  l 了解EST、序列标签(尤其是新一代测序仪产生的数据)、芯片数据和RNA-seq等数据库的基本内容

  l 了解基因组序列组装的基本原理

  l 了解基因识别软件和原理(包括真核与原核生物基因组)

  l 掌握DNA序列进化研究的基本方法和常用软件

  7.组学与精准医学

  考试内容

  l 人类基因组计划(理由、计划与实施)

  l 人类基因组计划的后续工作

  l 癌症和常见疾病的研究方法

  l 全基因组关联性(Whole Genome Association)研究

  l 精准医学的概念,组学如何和精准医学融合,为健康科学的发展提供基础保证

  考试要求

  l 了解人类基因组计划的历史

  l 不同定义下人类基因组基因的数量

  l 什么是SNP和HapMap计划

  l 了解精准医学研究的进展

  l 了解如何将组学和精准医学融合

  l 掌握全基因关联性研究和研究的基本方法

  l 掌握以组学数据为基础的遗传连锁分析,定位致病基因的方法

  二、主要参考书目

  1)基因组学(第3版);杨金水 编著;高等教育出版社。

  2)Lewin基因X;克雷布斯、戈尔茨坦、基尔帕特里克;江松敏译;科学出版社。


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